Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM29Q14134 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM29Q14134 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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