Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PDE1CQ14123 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PDE1CQ14123 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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