Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCNIQ14094 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms