Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDX39BQ13838 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DDX39BQ13838 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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