Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP1Q13835 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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