Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITGA7Q13683 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITGA7Q13683 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms