Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MTMR3Q13615 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MTMR3Q13615 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms