Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COX10Q12887 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COX10Q12887 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
COX10Q12887 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
COX10Q12887 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
COX10Q12887 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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