Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTN1Q12860 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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CNTN1Q12860 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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CNTN1Q12860 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CNTN1Q12860 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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