Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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KCNMA1Q12791 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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KCNMA1Q12791 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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KCNMA1Q12791 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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KCNMA1Q12791 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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KCNMA1Q12791 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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KCNMA1Q12791 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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KCNMA1Q12791 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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KCNMA1Q12791 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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KCNMA1Q12791 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
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KCNMA1Q12791 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KCNMA1Q12791 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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