Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms