Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD47Q08722 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD47Q08722 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms