Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF8Q02556 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms