Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms