Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDM2Q00987 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDM2Q00987 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms