Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUCB2P80303 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms