Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RAE1P78406 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAE1P78406 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAE1P78406 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAE1P78406 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RAE1P78406 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RAE1P78406 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RAE1P78406 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAE1P78406 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAE1P78406 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms