Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ASIC1P78348 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ASIC1P78348 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ASIC1P78348 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ASIC1P78348 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms