Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAB25P57735 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB25P57735 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB25P57735 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB25P57735 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RAB25P57735 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB25P57735 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms