Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRISP1P54107 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms