Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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PGGT1BP53609 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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PGGT1BP53609 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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PGGT1BP53609 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PGGT1BP53609 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PGGT1BP53609 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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