Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPC3P51654 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPC3P51654 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPC3P51654 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPC3P51654 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPC3P51654 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPC3P51654 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPC3P51654 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms