Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRE11P49959 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRE11P49959 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRE11P49959 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRE11P49959 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms