Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSNK1EP49674 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSNK1EP49674 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms