Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HOXA1P49639 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXA1P49639 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms