Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK8P49336 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK8P49336 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK8P49336 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK8P49336 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK8P49336 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK8P49336 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK8P49336 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK8P49336 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK8P49336 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK8P49336 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK8P49336 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK8P49336 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK8P49336 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK8P49336 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK8P49336 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms