Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRPC1P48995 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms