Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL15A1P39059 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL15A1P39059 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL15A1P39059 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL15A1P39059 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL15A1P39059 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COL15A1P39059 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL15A1P39059 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL15A1P39059 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL15A1P39059 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COL15A1P39059 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL15A1P39059 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms