Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCM5P33992 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCM5P33992 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MCM5P33992 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCM5P33992 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MCM5P33992 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms