Protein–RNA interactions for Protein: P30990

NTS, Neurotensin/neuromedin N, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTSP30990 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NTSP30990 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTSP30990 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTSP30990 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTSP30990 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms