Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD40LGP29965 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms