Protein–RNA interactions for Protein: P25398

RPS12, 40S ribosomal protein S12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS12P25398 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS12P25398 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS12P25398 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS12P25398 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS12P25398 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS12P25398 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS12P25398 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS12P25398 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS12P25398 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS12P25398 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS12P25398 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS12P25398 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS12P25398 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS12P25398 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms