Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTAFRP25105 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms