Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR2AP24928 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2AP24928 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms