Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGA6P23229 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms