Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB4AP20338 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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