Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTRB1P17538 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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