Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
VPREB1P12018 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms