Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CALM2P0DP24 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CALM2P0DP24 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms