Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SAA1P0DJI8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA1P0DJI8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms