Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SFTA3P0C7M3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms