Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTMAP06454 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTMAP06454 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTMAP06454 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTMAP06454 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTMAP06454 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTMAP06454 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTMAP06454 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTMAP06454 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTMAP06454 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTMAP06454 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTMAP06454 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTMAP06454 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms