Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE2O96020 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE2O96020 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNE2O96020 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNE2O96020 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE2O96020 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE2O96020 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE2O96020 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE2O96020 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE2O96020 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE2O96020 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE2O96020 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE2O96020 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE2O96020 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE2O96020 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE2O96020 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE2O96020 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNE2O96020 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms