Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTDNEP1O95476 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1O95476 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms