Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRPF40AO75400 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF40AO75400 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms