Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY75O60449 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY75O60449 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LY75O60449 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LY75O60449 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LY75O60449 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms