Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SIAH2O43255 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms