Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPQ1

Glycine cleavage system H protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPQ1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
A0A1W2PPQ1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
A0A1W2PPQ1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms