Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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