Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP4B1Q9Y6B7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP4B1Q9Y6B7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4B1Q9Y6B7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AP4B1Q9Y6B7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms